6月1日 延邊大學在全國文教戰線“群英會”上被評為全國先進單位。 6月 延邊醫學院召開第一次黨員代表大會，并選舉張逸民為書記。 6月 吉林省人民政府批準同意延邊大學新設無線電子學、有機合成、燃料工學、概率論數理統計等4個專業；延邊農學院增設農業機械化專業并于同年招生。
5月 根據中共中央東北局高等教育工作會議精神，對學校的相關專業進行了調整。由原有的7個系16個專業減為5個系10個專業。 10月 郭沫若為延邊醫學院題寫校名。
4月 吉林省教育廳批準延邊大學“除體育系外、其他各系、專業學制均為五年制。 6月 延邊州委書記朱德海陪同全國人大常委會副委員長阿沛?阿旺晉美到延邊藝術學校參觀。 6月22日~23日 國務院周恩來總理到延邊大學、延邊醫學院、延邊農學院視察工作。 9月 教育部批準延邊農學院農藥學和果樹專業合并為農學專業，學制仍為四年；畜牧和獸醫專業合并為畜牧獸醫專業，學制為五年。
2月 延邊醫學院召開第二屆黨員代表大會。選舉孫玉書為黨委書記。 4月 延邊大學頒布《學生獎勵辦法》（修改草案）、《學生助學金管理辦法》（草案）、《公費醫療預防工作條例》（草案）、《函授部工作條例》（草案），《函授生成績考核辦法》（草案）。 7月 經中共中央宣傳部批準，李羲一為延邊大學黨委書記。 8月 學校制定《延邊大學師資培養提高工作規劃》（1963~1972）和《延邊大學重點培養骨干教師規劃》（1963~1972）。 10月 教育部批復，延邊農學院農學專業從63級開始改為五年制。
4月1日 延邊大學隆重舉行建校十五周年慶祝大會。 7月12日~13日 朱德委員長、董必武副主席等來延邊大學、延邊醫學院、延邊農學院視察，朱德委員長和董必武副主席為學校題詞。 8月27日 延邊大學足球隊獲東北六大城市大學生足球賽冠軍。 12月 延邊大學制定了《關于文科改革工作計劃》（草案）。 12月31日吉林省委任命金文洙為延邊醫學院黨委書記、免去孫玉書黨委書記職務。
1月 延邊大學召開教學改革經驗交流會議。 7月18日 朝鮮民主主義人民共和國國立中央圖書館與延邊大學圖書館互贈書刊。 12月17日~21日 黨委召開延邊大學第六次黨員代表大會。李羲一當選為黨委書記。
6月 黨委成立了“延邊大學文化革命領導小組”。 7月 延邊州委“文化大革命”工作隊進駐延邊大學、延邊農學院。 8月 受席卷全國的“紅衛兵”運動的影響，延邊大學、延邊醫學院、延邊農學院都成立了群眾組織。 8月 大批學生去北京串聯。
8月~1968年1月 延邊大學副校長林民鎬在批斗中遭受了慘重的人身迫害。 11月 延邊農學院舉行革命委員會成立大會。
12月 成立延邊大學革命委員會。成立延邊醫學院革命委員會。
12月 吉林省革命委員會決定，撤消延邊農學院。后又幾經改動，校名定為延邊農業專科學校。 12月 根據中央文革“復課鬧革命”的指示，正式復課。 12月 延邊大學、延邊醫學院、延邊農學院召開全校大會、宣布第一批下放插隊落戶的干部、教師名單。
